醫用純水系統是制藥行業生產中用量最大、使用最廣的一種基本用水，醫藥用水用于生產過程及藥物制劑的制備，醫用純水系統是醫藥行業用水的主要設備，純化水是制藥業的生命線，產水水質不但要滿足醫藥行業生產用水要求，而且還要符合GMP等認證要求。
醫用純水系統工藝流程：
原水-原水泵+石英砂過濾器+活性炭過濾器+精密過濾器+一級反滲透設備+中間水箱+中間水泵+離子交換器+純化水箱+純水泵+紫外線殺菌器+微孔過濾器+用水點。
原水-原水泵+石英砂過濾器+活性炭過濾器+精密過濾器+一級反滲透設備+中間水箱+中間水泵+EDI系統-純化水箱+純水泵+紫外線殺菌器+微孔過濾器-用水點。
原水+原水泵+石英砂過濾器+活性炭過濾器+精密過濾器+第一級反滲透-PH調節中間水箱+第二級反滲透+純化水箱-純水泵+紫外線殺菌器+微孔過濾器+反滲透純化水用水點。
醫用純水系統對水質要求相對來說比較嚴格，常要求純化水的電阻率應高于15兆以上。為保證醫藥用超純水的用水安全，超純水的處理設備整個系統也都是全不銹鋼材質組合而成，而且在用水點之前都必須裝備殺菌裝置。
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